Mäkihypyn ja yhdistetyn seuraluokittelussa huomioitiin toimintakauden 1.4.2012-31.3.2013 yleisen sarjan, nuorten ja veteraanien SM-kisamenestys, Hopeasompa-finaalin kaikki sarjat, seurojen lisenssit ja Skipassit, mäkikoululaisten, valmentajien ja ohjaajien, ja koulutettujen valmentajien/ohjaajien sekä mäkituomareiden/teknisten asiantuntijoiden määrät.
Mäkihypyn ja yhdistetyn seuraluokittelun paras seura oli jälleen Lahden Hiihtoseura. Muilla kunniakirjoin palkituilla sijoilla jatkoivat viime vuodesta tutut Puijon Hiihtoseura toisella sijalla sekä kolmannella sijalla Kuusamon Erä-Veikot.
1. Lahden Hiihtoseura 575,28
2. Puijon Hiihtoseura 472,15
3. Kuusamon Erä-Veikot 322,22
4. Jyväskylän Hiihtoseura 252,55
5. Ounasvaaran Hiihtoseura 198,21
6. Kiteen Urheilijat 183,74
7. Siilinjärven Ponnistus 148,77
8. Kainuun Hiihtoseura 141,05
9. Paimion Urheilijat 124,80
10. Tampereen Pyrintö 108,73
11. Sotkamon Jymy 104,30
12. Helsingin Mäkihyppääjät 93,87
13. Kouvolan Hiihtoseura 87,96
14. Taivalkosken Kuohu 84,33
15. Alahärmän Kisa 68,9
16. Janakkalan Jana 65,37
17. Seinäjoen Hiihtoseura 62,40
18. Ylistaron Kilpa-Veljet 61,00
19. Vörå IF 58,76
20. Joutsenon Kullervo 58,03
21. Harjavallan Jymy 55,82
22. Pielaveden Sampo 49,68
23. Lieksan Hiihtoseura 39,10
24. Karijoen Tappara 38,18
25. Marttilan Murto 36,88
26. Valkeakosken Haka 35,94
27. Savonlinnan Hiihtoseura 34,09
28. Jokilaakson Mäkiseura 25,56
29. Pöytyän Urheilijat 23,28
30. Luumäen Pojat 12,66
31. Nurmon Jymy 11,49
32. Suolahden Urho 6,96
33. Kokkolan Veikot 6,52
34. Lapuan Virkiä 5,08
35. Haapaveden Urheilijat 3,39
35. Vetelin Urheilijat 3,39
